Налоговики предъявили претензии 50 резидентам «Сколково» из-за IT-льгот

Более 50 IT‑компаний — резидентов фонда «Сколково» столкнулись с претензиями налоговых органов. Причина — попытки использовать отраслевые IT‑льготы в том же году, когда организации лишились права на преференции для резидентов «Сколково».

Активность проверок выросла после марта 2025 года, когда истёк срок моратория на налоговые проверки IT‑компаний. Налоговые органы исходят из того, что если компания потеряла «сколковскую» льготу по налогу на прибыль, то претендовать на IT‑льготу в том же году нельзя. Этот подход закрепило письмо департамента налоговой политики Минфина в феврале 2026 года: применять пониженную ставку по налогу на прибыль можно только со следующего налогового периода (календарного года).

Советник практики налоговых споров МЭФ LEGAL Денис Кожевников подтвердил рост числа налоговых споров с резидентами «Сколково»:

«Ряд компаний в течение прошедшего налогового периода превысили допустимые пороги по выручке и прибыли для применения освобождений от налогообложения для резидентов „Сколково“. Попытки применить IT‑льготы вместо преференций для резидентов „Сколково“ закончились неудачно».

«Сколковская» льгота по налогу на прибыль (нулевая ставка) действует, пока прибыль компании не превысит 300 млн руб., а выручка — 1 млрд руб. Если эти пороги превышены, прибыль облагается по полной ставке с 1‑го числа года, в котором это произошло.

С 1 января 2026 года условия ужесточились: компании, одновременно являющиеся резидентами «Сколково» и IT‑компаниями, потеряли право совмещать наборы льгот — теперь нужно выбирать что‑то одно.

Что это значит для бизнеса?

• IT‑компании (при доле выручки от IT‑деятельности не ниже 70 %):

  • налог на прибыль: 0 % в 2022–2024 гг., 5 % — с 2025 по 2030 г.;

  • страховые взносы: 7,6 % до 2025 г. включительно, с 2026 г. — 15 % в пределах единой предельной базы по зарплате и 7,6 % с суммы превышения;

  • НДС: освобождение при продаже ПО из реестра Минцифры.

• Резиденты «Сколково» (в т. ч. аккредитованные IT‑компании):

  • налог на прибыль — 0 %;

  • страховые взносы — 14 % до 2025 г., с 2026 г. — 30 % с сумм в пределах 1,5 МРОТ и 15 % с сумм выше;

  • НДС — освобождение;

  • налог на имущество — 0 %.

Льготы для резидентов «Сколково» рассчитаны на десять лет, но их можно потерять раньше — например, при превышении порога прибыли или выручки.

Дополнительные риски

Эксперты также отмечают рост претензий к IT‑компаниям из‑за дробления бизнеса с целью получения налоговой выгоды. Налоговые органы детально проверяют:

• наличие реального IT‑компонента в деятельности;

• изменения бизнес‑модели;

• деловые цели создания IT‑подразделений;

• соответствие платежей рыночной стоимости услуг.

Как отмечают участники рынка, IT‑сектор сейчас находится в ожидании формирования универсальных подходов налоговых органов к проверке правомерности применения льгот. Это может привести к новым спорам и доначислениям для компаний, которые ранее считали свои схемы законными.

Читайте подробнее: РБК